Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CalcbQ99MP3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CalcbQ99MP3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CalcbQ99MP3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CalcbQ99MP3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms