Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gdpd3Q99LY2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gdpd3Q99LY2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gdpd3Q99LY2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms