Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cds2Q99L43 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cds2Q99L43 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cds2Q99L43 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms