Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DhddsQ99KU1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DhddsQ99KU1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DhddsQ99KU1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DhddsQ99KU1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DhddsQ99KU1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms