Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Clint1Q99KN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clint1Q99KN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clint1Q99KN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clint1Q99KN9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms