Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EpcamQ99JW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EpcamQ99JW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms