Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl22Q99JN2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl22Q99JN2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl22Q99JN2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl22Q99JN2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms