Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Derl1Q99J56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Derl1Q99J56 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Derl1Q99J56 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms