Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PdgfdQ925I7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PdgfdQ925I7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PdgfdQ925I7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PdgfdQ925I7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PdgfdQ925I7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PdgfdQ925I7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PdgfdQ925I7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PdgfdQ925I7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PdgfdQ925I7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PdgfdQ925I7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms