Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf3Q920N1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf3Q920N1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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