Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med28Q920D3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med28Q920D3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Med28Q920D3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med28Q920D3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms