Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha2Q91Y17 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdha2Q91Y17 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha2Q91Y17 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha2Q91Y17 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha2Q91Y17 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms