Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nlrp6Q91WS2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nlrp6Q91WS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Nlrp6Q91WS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nlrp6Q91WS2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nlrp6Q91WS2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms