Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx11Q91WL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx11Q91WL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx11Q91WL6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx11Q91WL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms