Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zkscan3Q91VW9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zkscan3Q91VW9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zkscan3Q91VW9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan3Q91VW9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
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