Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam3cQ91VU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3cQ91VU0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam3cQ91VU0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam3cQ91VU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms