Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d2Q8VD57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sft2d2Q8VD57 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sft2d2Q8VD57 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms