Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nae1Q8VBW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nae1Q8VBW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nae1Q8VBW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nae1Q8VBW6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms