Protein–RNA interactions for Protein: Q8R420

Abca3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca3Q8R420 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Abca3Q8R420 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Abca3Q8R420 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Abca3Q8R420 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Abca3Q8R420 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Abca3Q8R420 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Abca3Q8R420 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Abca3Q8R420 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,7 ms