Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8R3C1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Q8R3C1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R3C1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R3C1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R3C1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms