Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8R3C1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8R3C1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q8R3C1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q8R3C1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q8R3C1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8R3C1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Q8R3C1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8R3C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R3C1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R3C1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q8R3C1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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