Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B4

Eif3c, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3cQ8R1B4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Eif3cQ8R1B4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Eif3cQ8R1B4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Eif3cQ8R1B4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3cQ8R1B4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms