Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gga1Q8R0H9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gga1Q8R0H9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gga1Q8R0H9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms