Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PolbQ8K409 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolbQ8K409 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolbQ8K409 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms