Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Matr3Q8K310 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Matr3Q8K310 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Matr3Q8K310 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Matr3Q8K310 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms