Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf39Q8K2Z2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf39Q8K2Z2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf39Q8K2Z2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf39Q8K2Z2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf39Q8K2Z2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf39Q8K2Z2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms