Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl47Q8K2Y7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl47Q8K2Y7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl47Q8K2Y7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl47Q8K2Y7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms