Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud6bQ8K2H2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Otud6bQ8K2H2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Otud6bQ8K2H2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Otud6bQ8K2H2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms