Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TwnkQ8CIW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TwnkQ8CIW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TwnkQ8CIW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TwnkQ8CIW5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms