Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEF1

Fem1c, Protein fem-1 homolog C, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fem1cQ8CEF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fem1cQ8CEF1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fem1cQ8CEF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fem1cQ8CEF1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fem1cQ8CEF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms