Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef8Q8CE24 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef8Q8CE24 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef8Q8CE24 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pramef8Q8CE24 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms