Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT5

4930415O20Rik, MCG18412, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930415O20RikQ8CDT5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930415O20RikQ8CDT5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930415O20RikQ8CDT5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930415O20RikQ8CDT5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms