Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc38Q8CDN8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc38Q8CDN8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc38Q8CDN8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc38Q8CDN8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc38Q8CDN8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms