Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms