Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc113Q8C5T8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc113Q8C5T8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc113Q8C5T8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc113Q8C5T8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc113Q8C5T8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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