Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8C5C9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C5C9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q8C5C9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C5C9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C5C9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8C5C9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C5C9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C5C9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C5C9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8C5C9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8C5C9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8C5C9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms