Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccz1Q8C1Y8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccz1Q8C1Y8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccz1Q8C1Y8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccz1Q8C1Y8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccz1Q8C1Y8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms