Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rccd1Q8BTU7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rccd1Q8BTU7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rccd1Q8BTU7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms