Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,6■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,59■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Ap3s2Q8BSZ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19,58■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19,56■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,53■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19,52■□□□□ 0,72
Ap3s2Q8BSZ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,5■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19,5■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19,5■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,49■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,48■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19,46■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Ap3s2Q8BSZ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,45■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Ap3s2Q8BSZ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,8 ms