Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efemp1Q8BPB5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efemp1Q8BPB5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efemp1Q8BPB5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efemp1Q8BPB5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efemp1Q8BPB5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms