Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bnc2Q8BMQ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bnc2Q8BMQ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bnc2Q8BMQ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnc2Q8BMQ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bnc2Q8BMQ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc2Q8BMQ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc2Q8BMQ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bnc2Q8BMQ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bnc2Q8BMQ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms