Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dupd1Q8BK84 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dupd1Q8BK84 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dupd1Q8BK84 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms