Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJW7

Eme1, Crossover junction endonuclease EME1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme1Q8BJW7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eme1Q8BJW7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eme1Q8BJW7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Eme1Q8BJW7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Eme1Q8BJW7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eme1Q8BJW7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eme1Q8BJW7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eme1Q8BJW7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eme1Q8BJW7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eme1Q8BJW7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eme1Q8BJW7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eme1Q8BJW7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eme1Q8BJW7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms