Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp2bQ8BJF9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp2bQ8BJF9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp2bQ8BJF9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chmp2bQ8BJF9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms