Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmd3Q8BHD4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Frmd3Q8BHD4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frmd3Q8BHD4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms