Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Susd4Q8BH32 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Susd4Q8BH32 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Susd4Q8BH32 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Susd4Q8BH32 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Susd4Q8BH32 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms