Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmco3Q8BH01 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco3Q8BH01 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmco3Q8BH01 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmco3Q8BH01 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms