Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp4f39Q8BGU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp4f39Q8BGU0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp4f39Q8BGU0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp4f39Q8BGU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms