Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubash3bQ8BGG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubash3bQ8BGG7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubash3bQ8BGG7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms