Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Htatsf1Q8BGC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Htatsf1Q8BGC0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Htatsf1Q8BGC0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Htatsf1Q8BGC0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.4 ms