Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG28

B3galnt2, UDP-GalNAc:beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3galnt2Q8BG28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
B3galnt2Q8BG28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B3galnt2Q8BG28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B3galnt2Q8BG28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
B3galnt2Q8BG28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3galnt2Q8BG28 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms